【摘要】 3月9日,亚马逊云技术宣布最近与加拿大不列颠哥伦比亚大学云创新中心(UBCCIC)合作,基于亚马逊云技术超级计算平台,帮助国际科学家团
3月9日,亚马逊云技术宣布最近与加拿大不列颠哥伦比亚大学云创新中心(UBCCIC)合作,基于亚马逊云技术超级计算平台,帮助国际科学家团队在短短11天内搜索近600万个公共生物样本,成功识别了13万多种新型RNA病毒,包括9种新型冠状病毒。
在亚马逊云技术的帮助下,UBCCIC团队和全球计算病毒学家启动了Theopenvirome(开放病毒组)项目,创建了开放的病毒发现云计算平台Seratus。目前,该研究结果已发表在科学杂志《自然》上,并创建了一个开放的病毒数据库,与全球科学界分享研究结果,以帮助加快RNA病毒的研究。
据报道,Theopenvirome项目的研究人员只花了8周时间在亚马逊云技术上成功地建立了一个超级计算平台。凭借亚马逊云技术卓越的弹性计算能力,它们可以快速处理数百万GB数据,并获得显著的成本效益。该团队在亚马逊云技术Amazonsimplestorageservice中镜像了病毒基因测序数据库SRA,然后使用亚马逊云技术弹性计算云实例Amazonelasticomputecloud(Amazonec2)来分析数据集。
最后,在11天内,该团队处理了570万个测序数据集,只花费了2.4万美元,发现了13万种新的RNA病毒。在此之前,经过几十年的数据分析,科学家们只发现了1.5万种病毒。在使用亚马逊云技术的基础设施和服务后,Theopenvirome项目团队在发现新病毒方面节省了数百万美元和数年的时间。
此外,研究人员认为,基于亚马逊云技术的Seratus平台不仅可以识别潜在的有害新病毒,还可以提醒科学家注意新冠肺炎SARS-Cov-2virus的潜在突变,帮助改善诊断测试和疫苗开发,为医疗政策决策者提供更有效的指导。